К 1994 г. идентифицированы около 400 мутаций в гене гемофилии В. Подавляющее большинство из них - замены нуклеотидов, приводящие к заменам аминокислот или к образованию стоп-кодонов. Характерно практически полное отсутствие выраженных мажорных мутаций и доминирующих областей повышенной частоты мутирования. Только одна мутация - I397T - встретилась в 7 семьях. Около 42% точечных мутаций возникают в CpG-динуклеотидах [Bottema C.D.K. et al., 1993]. Показано, что частота G-A- или С-Т-транзиций в CpG-сайтах в 24 раза выше, чем в других местах гена [Koeberl D.D. et al., 1990]. Кроме того, в CpG-динуклеотидах гена F9 в 7,7 раз чаще возникают трансверсии (А-Т, А-С, G-T или G-C). Это объясняется тем, что содержание (G+C) в кодирующих областях F9-rem составляет 40% [Bottema C.D.K. et al., 1991].
В 40% случаев при тяжелых ингибиторных формах гемофилии В у пациентов обнаруживаются делеции различной протяженности. Около 10% точковых мутаций локализованы в донорных или акцепторных сайтах сплайсинга или создают новые сайты сплайсинга внутри интронов. В одной семье разрушение гена произошло в результате инсерции Alu-элемента в экзон 5 [Vidaud D. et al., 1993]. Описано 13 точковых мутаций в промоторной области гена F9. Именно с такими мутациями связана Лейденовская (Leyden) форма заболевания, при которой к возрасту половозрелости наступает улучшение многих клинических показателей и, в частности, исчезает кровоточащий диатез. Объясняется это тем, что мугации в промоторной области могут приводить к переключению конститутивной экспрессии гена на стероид-гормонзависимую, нарушая связывание гепатоцитарного ядерного фактора 4 (HNF-4), принадлежащего к суперсемейству транскрипционных факторов для рецепторов стероидных гормонов.
